現在，由于國內外各地的農藥針對于高效殺滅害蟲這一方針，不斷改良的農藥毒性、污染性也都更過于大，產生的廢水也含是污染成分復雜、難降解物質多且毒性大，使用傳統處理工藝已經起不到多大作用。
所以，如今針對于農藥廢水的這一特征，常用的處理主要還是物化法，而常用的水處理藥劑有聚合氯化鋁、聚合硫酸鐵及聚丙烯酰胺等，但是這些處理方法單獨使用于處理農藥廢水的話并不能發揮多大作用，且有的還會造成二次污染滋生。
對此現在常用多工藝組合處理，先是用化學法進行預處理，可提升農藥廢水的可生化性，有利于后續的物理法處理，物理法是通過投加聚合氯化鋁等凈水劑對水中懸浮物及污染物進行吸附形成絮狀物，再用沉淀法對其進行沉淀去除，從而達凈化的目的。
